Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV2

Pcid2, PCI domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcid2Q8BFV2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcid2Q8BFV2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcid2Q8BFV2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcid2Q8BFV2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcid2Q8BFV2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms