Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrde2Q80XC6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrde2Q80XC6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrde2Q80XC6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nrde2Q80XC6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrde2Q80XC6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrde2Q80XC6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrde2Q80XC6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms