Protein–RNA interactions for Protein: Q80X82

Sympk, Symplekin, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SympkQ80X82 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms