Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Thnsl2Q80W22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thnsl2Q80W22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thnsl2Q80W22 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Thnsl2Q80W22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms