Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnma8aQ80VM8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnma8aQ80VM8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnma8aQ80VM8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms