Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnphQ80U23 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SnphQ80U23 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnphQ80U23 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnphQ80U23 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms