Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EpopQ7TNS8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EpopQ7TNS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpopQ7TNS8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EpopQ7TNS8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms