Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp397Q7TNK4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp397Q7TNK4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp397Q7TNK4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp397Q7TNK4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp397Q7TNK4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zfp397Q7TNK4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp397Q7TNK4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp397Q7TNK4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms