Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms