Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tlr13Q6R5N8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr13Q6R5N8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.6 ms