Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NfrkbQ6PIJ4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfrkbQ6PIJ4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NfrkbQ6PIJ4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms