Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup98Q6PFD9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup98Q6PFD9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup98Q6PFD9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup98Q6PFD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup98Q6PFD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms