Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1cQ6PDZ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms