Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc36Q6PDM4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc36Q6PDM4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms