Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Zbtb40Q6PCS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zbtb40Q6PCS8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zbtb40Q6PCS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zbtb40Q6PCS8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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