Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Papd7Q6PB75 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd7Q6PB75 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd7Q6PB75 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Papd7Q6PB75 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms