Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn7Q6P5G6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn7Q6P5G6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn7Q6P5G6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn7Q6P5G6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn7Q6P5G6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn7Q6P5G6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn7Q6P5G6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn7Q6P5G6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn7Q6P5G6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn7Q6P5G6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms