Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms