Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig3Q6P1C6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrig3Q6P1C6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms