Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc189Q6NZQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc189Q6NZQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc189Q6NZQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc189Q6NZQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms