Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ptpdc1Q6NZK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpdc1Q6NZK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ptpdc1Q6NZK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms