Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fbxo41Q6NS60 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fbxo41Q6NS60 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fbxo41Q6NS60 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fbxo41Q6NS60 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Fbxo41Q6NS60 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms