Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt87Q6IMF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt87Q6IMF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt87Q6IMF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt87Q6IMF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms