Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap20Q6IFT4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap20Q6IFT4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap20Q6IFT4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap20Q6IFT4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms