Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6DFW0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6DFW0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6DFW0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q6DFW0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6DFW0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6DFW0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6DFW0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q6DFW0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q6DFW0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q6DFW0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q6DFW0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q6DFW0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q6DFW0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q6DFW0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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