Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx11Q6AXC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx11Q6AXC6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx11Q6AXC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms