Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp7Q6A4J8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp7Q6A4J8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms