Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f3Q63955 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f3Q63955 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms