Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff3Q62395 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff3Q62395 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tff3Q62395 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff3Q62395 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff3Q62395 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tff3Q62395 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms