Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddr2Q62371 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddr2Q62371 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Ddr2Q62371 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddr2Q62371 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddr2Q62371 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddr2Q62371 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddr2Q62371 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddr2Q62371 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddr2Q62371 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddr2Q62371 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms