Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsnQ62348 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsnQ62348 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsnQ62348 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsnQ62348 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsnQ62348 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsnQ62348 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsnQ62348 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsnQ62348 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsnQ62348 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TsnQ62348 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TsnQ62348 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TsnQ62348 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TsnQ62348 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TsnQ62348 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TsnQ62348 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TsnQ62348 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TsnQ62348 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms