Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irf9Q61179 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irf9Q61179 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irf9Q61179 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Irf9Q61179 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irf9Q61179 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.8 ms