Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc1Q61056 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc1Q61056 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc1Q61056 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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