Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkiQ60698 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkiQ60698 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SkiQ60698 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SkiQ60698 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SkiQ60698 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SkiQ60698 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SkiQ60698 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SkiQ60698 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SkiQ60698 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SkiQ60698 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms