Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myh4Q5SX39 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Myh4Q5SX39 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh4Q5SX39 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh4Q5SX39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Myh4Q5SX39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh4Q5SX39 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms