Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

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Length 663 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf145Q5SWK7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf145Q5SWK7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf145Q5SWK7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf145Q5SWK7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf145Q5SWK7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf145Q5SWK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms