Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms