Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynrgQ5SV85 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynrgQ5SV85 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynrgQ5SV85 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms