Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scarf1Q5ND28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scarf1Q5ND28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scarf1Q5ND28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms