Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Znf608Q56A10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Znf608Q56A10 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Znf608Q56A10 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Znf608Q56A10 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Znf608Q56A10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms