Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdp2Q504M2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdp2Q504M2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdp2Q504M2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms