Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTC0

B020004J07Rik, RIKEN cDNA B020004J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004J07RikQ3UTC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B020004J07RikQ3UTC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B020004J07RikQ3UTC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B020004J07RikQ3UTC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004J07RikQ3UTC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B020004J07RikQ3UTC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004J07RikQ3UTC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004J07RikQ3UTC0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004J07RikQ3UTC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004J07RikQ3UTC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004J07RikQ3UTC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms