Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mindy4Q3UQI9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mindy4Q3UQI9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mindy4Q3UQI9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy4Q3UQI9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms