Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330014E10RikQ3UL33 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms