Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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