Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp2Q3UJK4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtpbp2Q3UJK4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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