Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf44Q3UHJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf44Q3UHJ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf44Q3UHJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf44Q3UHJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms