Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec24aQ3U2P1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sec24aQ3U2P1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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