Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ89

Sec31b, Protein transport protein Sec31B, mousemouse

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31bQ3TZ89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec31bQ3TZ89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec31bQ3TZ89 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec31bQ3TZ89 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31bQ3TZ89 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sec31bQ3TZ89 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec31bQ3TZ89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec31bQ3TZ89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms