Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam172aQ3TNH5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam172aQ3TNH5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms